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ヘリコバクター・ピロリ菌除菌は胃癌発生予防に有用と言われる一方で除菌後の胃癌発見も認められる。
除菌後に発見される胃癌のうち分化型胃癌では緩徐な発育経過が推測されている。未分化胃癌もあり比較的早い発育が推察される。
除菌前の胃体部小わんの萎縮と除菌後の胃癌発生に関連性を指摘する報告もある。
高度の萎縮症例では除菌による胃癌発生予防効果が少ない可能性もある。
胃潰瘍より十二指腸潰瘍での除菌の場合に胃癌発生が少ない報告もあり、前庭部胃炎程度の段階での除菌が胃癌発生予防には有効であるかもしれない。